Archaea

Les Archaea ou Archées (/aʁ.ke/), du grec ancien ἀρχαῖος / arkhaîos (« originel, primitif »), anciennement archéobactéries, sont des micro-organismes unicellulaires procaryotes, c'est-à-dire des organismes constitués, comme les bactéries, d'une cellule unique qui ne comprend ni noyau ni organites, à la différence des eucaryotes. Les Archées sont classiquement présentées comme formant un domaine d'organismes procaryotes phylogénétiquement distincts des bactéries et morphologiquement distincts des eucaryotes, dans un système à trois domaines. Cependant les analyses moléculaires montrent que les eucaryotes prennent leur origine parmi les Archées et plus précisément les Archées d'Asgård. De ce fait, ces Archées procaryotes forment un clade avec les eucaryotes mais ne constituent qu'un groupe paraphylétique situé à la base de ces derniers. Comme les poissons ou les reptiles, ils forment une entité pratique à utiliser car morphologiquement identifiable, mais ne constituent pas un taxon — et donc un domaine — phylogénétiquement valide. Du point de vue de leur génétique, leur biochimie et leur biologie moléculaire, les Archées sont des organismes aussi différents des bactéries que des eucaryotes. Les enzymes réalisant la réplication de l'ADN, la transcription de l'ADN en ARN ainsi que la traduction de l'ARN messager en protéines chez les Archées sont apparentées à celles des eucaryotes et non à celles des bactéries, de même que la présence d'histones dans le matériel génétique des Archées rapproche ces dernières des eucaryotes et les distingue des bactéries. Par ailleurs, les gènes des Archées possèdent des introns et leur ARN messager subit des modifications post-transcriptionnelles, ce qui est le cas également chez les eucaryotes mais pas chez les bactéries. D'autre part, certaines espèces d’Archées possèdent des voies métaboliques qui n'existent ni chez les bactéries ni chez les eucaryotes, comme la méthanogenèse chez les Archées méthanogènes, tandis que les Archées dans leur ensemble sont dépourvues d'acide gras synthase, contrairement à...