Candida auris

Candida auris est une espèce de levures saccharomycetes, identifiée pour la première fois en 2009 à partir d'une souche isolée de l'oreille externe chez une patiente japonaise. Le Candida auris est capable de s’installer durablement dans la peau et les follicules pileux, un habitat où interagissent champignon, microbiome et immunité. Il peut alors être responsable de candidose (souvent acquise à l'hôpital ou en maison de retraite par des patients immunodéprimés). Parfois qualifié de « super-champignon », il est capable de provoquer une candidose invasive et grave, voire mortelle en infectant le système urinaire, la circulation sanguine, le système nerveux central et divers organes internes. Cette levure est considérée comme un pathogène émergent car une nette augmentation du nombre d'infections du C. auris est constatée dans une dizaine de pays de cinq continents depuis les années 2010 et elle cause des épidémies mortelles en milieu hospitalier. Curieusement, bien que présentant une certaine diversité génétique (entre souches différentes), il semblait « sorti de nulle part » et il a été signalé, sous forme de plusieurs clades génétiquement distincts, presque au même moment, sur trois continents différents, ce qui suggère des émergences indépendantes plutôt qu'une seule diffusion globale. Il s'est rapidement répandu dans des hôpitaux et maisons de retraite d'une trentaine de pays. Son succès épidémiologique pourrait être lié au réchauffement climatique, car c'est une espèce thermotolérante, ce qui contribue à sa survie et à son expansion dans le contexte du réchauffement global. Son traitement est compliqué car il est difficile à identifier et aisément confondu avec d'autres espèces proches comme Candida haemulonii, Candida famata. De plus, le C. auris est souvent multi-résistant aux antifongiques communs. En 2022, l'OMS le classe dans le groupe « priorité critique » de sa liste des champignons à surveiller en priorité.