Transcriptomique

La transcriptomique est l'étude de l'ensemble des ARN produits lors du processus de transcription d'un génome, c'est-à-dire lors de la production passage de la molécule d'ADN à celle d'ARN. Les ARN peuvent être codant ou non codant. Un transcriptome capture un instantané dans le temps de l'ensemble des transcrits présents dans une cellule. La transcriptomique permet de savoir quels processus cellulaires sont potentiellement actifs et lesquels sont dormants. En particulier, la transcriptomique permet de savoir quels gènes sont exprimés et lesquels ne le sont pas. Les premières tentatives d'étude des transcriptomes entiers ont commencé au début des années 1990. Les avancées technologiques qui ont suivi depuis la fin des années 1990 ont transformé le domaine à plusieurs reprises et ont fait de la transcriptomique une discipline très répandue dans les sciences biologiques. Il existe deux techniques contemporaines clés dans ce domaine : les puces à ADN, qui quantifient un ensemble de séquences prédéterminées, et le séquençage de l'ARN, qui utilise le séquençage à haut débit pour enregistrer tous les transcrits. Au fur et à mesure que la technologie s'est améliorée, le volume de données produites par chaque expérience sur le transcriptome a augmenté. En conséquence, les méthodes d'analyse des données ont été régulièrement adaptées pour analyser de manière plus précise et plus efficace des volumes de données de plus en plus importants. Les bases de données transcriptomiques se sont donc enrichies et sont devenues de plus en plus utiles au fur et à mesure que les chercheurs continuaient à collecter et à partager des transcriptomes. Il serait presque impossible d'interpréter les informations contenues dans un transcriptome sans la connaissance des expériences précédentes. La mesure de l'expression des gènes d'un organisme dans différents tissus ou conditions, ou à différents moments, fournit des informations sur la manière dont les gènes sont régulés...