AlphaFold

AlphaFold é um programa de inteligência artificial desenvolvido pela DeepMind do Google que realiza previsões da estrutura de proteínas. O programa é projetado como um sistema de aprendizagem profunda. O software AlphaFold AI se destacou em duas versões principais. Uma equipe de pesquisadores que usou o AlphaFold 1 (2018) ficou em primeiro lugar na classificação geral da 13ª Avaliação Crítica de Técnicas para Predição de Estrutura de Proteínas (CASP em inglês) em dezembro de 2018. O programa foi particularmente bem-sucedido em prever a estrutura mais precisa para alvos classificados como os mais difíceis pelos organizadores da competição, onde nenhuma estrutura de modelo existente estava disponível a partir de proteínas com uma sequência parcialmente semelhante. Uma equipe que usou o AlphaFold 2 (2020) repetiu a colocação na competição CASP em novembro de 2020. A equipe atingiu um nível de precisão muito maior do que qualquer outro grupo. Ela pontuou acima de 90 para cerca de dois terços das proteínas no teste de distância global CASP (global distance test ou GDT em inglês), um teste que mede o grau em que a estrutura prevista por um programa computacional é semelhante à estrutura determinada no experimento de laboratório, com 100 sendo uma correspondência completa, dentro do corte de distância usado para calcular o GDT. Os resultados do AlphaFold 2 no CASP foram descritos como "surpreendentes" e transformacionais. Alguns pesquisadores notaram que a precisão não é alta o bastante para um terço de suas previsões e que o programa não revela o mecanismo ou as regras do dobramento de proteínas para que o problema de dobramento de proteínas seja considerado resolvido. No entanto, tem havido um respeito generalizado pela conquista técnica. Desde 5 de março de 2021, a DeepMind não disponibilizou nenhum código para o AlphaFold 2 publicamente. Quatro meses depois de anunciar os...